接着《黑暗物质》第一季的剧情，在结束那段不知为何而战的”旅程”后，人类发现了宇宙深处隐藏的巨大力量来源，那是一个背叛和神秘的黑暗秘密，于是，新的旅途再一次开始了。

该剧根据资深科幻编剧Joseph Mallozzi和Paul Mullie（《星际之门》系列剧集的创作）的同名图画小说改编，一艘被遗弃的太空飞船的六个船员们从冬眠状态中醒来。他们不记得自己是谁，也不记得是如何上船的。唯一的线索是装满武器的货舱以及一个目的地：即将被战火蔓延的外星殖民。旅途危机重重，还